車内に水が入ってしまう原因は色々
ゴムやリテーナー等の劣化、ガラス廻り、シール材等のひび割れ、後付け配線の取り回し、サビによるモノ等々、
これらが複数重なってという場合もあります
今回はチョとレア?なケース

ドアのウエザーストリップの劣化(潰れ)によって

フロントピラードアストッパー取付部からの浸水

ゴムの劣化等でもしココから水が入っても、通常はサイドシルの中に入って水抜き穴から外に出るのですが
こちらの車両はサイドシルに発泡ウレタン、、水の行き場がなくなって室内に入ってきていました

こんな所での弊害もある発泡ウレタン、入れるのは簡単でも取り除くのは大掛かりな作業だし、やっぱりお勧めできません
雨漏れ自体はウエザーストリップの交換で止まるはずです